1.Ubuntu20.04安装CASToR

Download | CASToR (源代码下载)

在castor文件夹同级目录新建build文件夹和install文件夹:

cd build

cmake-gui  官方文档有解释这些模块的目的，但是DEVEL勾选后会编译出错，想要从GATE仿真到CASToR重建，需要勾选GATE_UTILITIES，而MPI和OMP分别代表多进程和多线程，根据自己需求勾选。点击Configure和Generate即可

make -j64

make install

最后在.bashrc中添加install/bin的路径即可

2.使用

2.1从gate仿真出的root结果进行重建

2.1.1 .geom->.lut/.hscan (默认都是PET_GE的几何信息，需要找到.cc文件自己改)

castor-PetScannerLutEx -alias PET_GE_GATE.geom

2.1.2 .root->.cdh/cdf

castor-GATERootToCastor -i input_file.root  #需要转换的root文件
                        -o output_file      #输出文件名
                        -m ../xx.mac        #GATE仿真用到的mac脚本文件
                        -s xx.geom          #需要在config/scanner里面转化成.lut才行

2.1.3 .cdh/.cdf->.img

castor-recon    -df input_file.Cdh     #输入文件
                -opti MLEM             #迭代算法
                -it 5:28               #迭代次数以及划分子集数
                -proj joseph           #系统矩阵
                -conv gaussian,2,2,2::psf    #卷积，高斯
                -dim 256,256,256        #重建后的图像尺寸
                -vox 1,1,1              #重建后像素尺寸mm
                -dout output_filename   #输出文件
                -oit -1                 #只保存最后一次迭代结果
                -th 0                   #最大线程

2.2 从listmode进行重建

2.2.1 .geom文件

2.2.2 listmode->.cdh/cdf

2.2.3 .cdh/.cdf->.img

3.参考资料

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更多细节待研究更新。。。