GPU加速如何提升CatBoost的训练速度?

发布于:2023-09-27 ⋅ 阅读:(170) ⋅ 点赞:(0)

作者:禅与计算机程序设计艺术

1.简介

随着近几年云计算、大数据、高性能计算等领域的发展,越来越多的应用将转向基于GPU的并行计算平台,尤其是在机器学习领域。GPU的计算能力比CPU更强,能够达到数十倍甚至上百倍的加速比。而目前,开源界的深度学习框架,比如TensorFlow、PyTorch、MXNet等都提供了基于GPU的支持。除此之外,像CatBoost这样的类别型决策树模型也逐渐受到GPU的关注。

在本文中,我们将介绍CatBoost,它是由Yandex开发的一款开源类别型决策树算法库,可以在训练过程中利用GPU进行加速。具体的,本文将从以下几个方面阐述CatBoost加速训练过程中的一些关键点:

  1. CatBoost适合采用GPU的场景;
  2. CatBoost如何利用GPU进行训练;
  3. 使用GPU进行加速时需要注意的问题及优化策略;
  4. 在线和离线训练对GPU加速的影响;
  5. 为何用GPU可以带来的训练加速效果;
  6. GPU的算力是怎样体现出来的;
  7. 最后总结一下,我们能从本文所述内容中获得哪些启发或收获。

2.基本概念

2.1 什么是类别型决策树(CART)?

类别型决策树(CART)是一种分类与回归树模型。通过分割特征空间,找到使得目标函数最小化的分割点,来建立分类与回归树。它属于集成学习方法,即将多个弱模型集成到一起,形成一个强模型。CART模型由决策树组成,每个决策树只考虑一部分特征的取值范围,并选择最佳切分特征和最优切分点。

CART算法的一般流程如下图所示:

图中,第一步为收集训练数据,包括输入X和输出y。第二步为构造根节点,即将所有的训练数据放入根节点。第三步为选择最佳分割特征和最优切分点,选择最大信息增益作为分割依据。第四步为递归地构建子节点,直到所有叶节点处停止。最后,将训练数据的输出用叶节点上的均值表示,或者用多数表决的方式决定输出值。

2.2 CatBoost是什么?

CatBoost是一个基于树的模型,类似于CART。但是相对于CART来说,它采用了更加有效的算法设计方法——梯度提升(Gradient Boosting)。

正如CART模型一样,CatBoost也是基于树的模型。但不同的是,CatBoost不是每次迭代都选取最佳的特征和最优的切分点,而是首先利用负梯度下降法(Gradient Descent)拟合残差(Residual),然后加入新的树结构,从而进一步降低预测值的方差。因此,CatBoost有着更好的处理非平稳数据、缺失值、异方差性、高维空间数据建模的能力。

CatBoost的特色之一是可以进行在线学习,也就是说可以给定一部分数据,训练出模型后,接着接受新的数据进行增量训练。这种特性使得CatBoost更适用于流式数据处理、实时数据分析等应用场景。

2.3 GPU加速相关知识

2.3.1 GPU简介

计算机图形学(Graphics Processing Unit,GPU)是一种用于图像渲染和可视化等计算密集型任务的硬件加速器。由英伟达(NVIDIA)、AMD等厂商研制,主要用于游戏视频渲染、CAD、图像处理、量子计算、生物信息等领域。

目前,主流的GPU都是由带有CUDA编程接口的多核芯片组成,其中包含由256个32位浮点运算单元组成的SM(Streaming Multiprocessor)核。每张GPU卡具有两种核心类型——Graphics Core(G)和Compute Core(C),分别用于渲染和计算任务。同时,NVIDIA推出了一款叫做GeForce RTX系列显卡,将计算核心升级到了Ampere架构,单块芯片的性能可以超过20万TFLOPS。

2.3.2 CUDA编程语言

CUDA(Compute Unified Device Architecture)是一种针对GPU的编程语言,具有高性能、易用、可移植、兼容性强等特点。它的运行环境由主机端和设备端组成。主机端通常是指CPU,设备端则是指GPU。在GPU上进行计算之前,必须先把数据传输到设备端的内存上。

CUDA编程语言遵循OpenCL规范,因此,熟悉OpenCL编程语言的人也可以快速上手。两者之间的区别主要在于CUDA基于C/C++语言,而OpenCL基于纯粹的OpenCL语言,具备更高的灵活性。

2.3.3 CUDA与OpenCL的区别

CUDA与OpenCL之间最大的不同是它们的层次划分。CUDA是基于底层的驱动接口直接控制GPU硬件的,而OpenCL则提供了运行时API接口,允许开发者创建自己的GPU应用程序。

CUDA的定位是异构系统编程,它提供各种各样的设备API接口,包括向量指令集、矩阵乘法指令、随机数生成、幻象映射等高级功能。而OpenCL的定位是向异构设备提供通用的计算能力。因此,CUDA用于编写独立于平台的程序,OpenCL用于编写特定设备类型的程序。

3. CatBoost适合采用GPU的场景

虽然很多深度学习框架已经支持了GPU的训练加速,但是CatBoost是否真的适合采用GPU进行加速呢?下面我们来看一下。

3.1 数据规模

首先,关于数据规模,根据研究团队经验,在训练数据量较大的情况下,采用GPU进行训练的效果明显要比CPU快很多。由于树模型的复杂度和参数数量的关系,树的个数越多,数据量越大,训练时间就越长,所以在数据量比较小的时候建议不要使用GPU。

3.2 计算复杂度

再来谈谈计算复杂度。相对于CART,CatBoost模型的训练过程要复杂的多,因为每一次迭代都需要拟合残差,这个过程的时间复杂度是O(n),其中n是数据量,占训练时间的很大一部分。如果采用GPU训练,那么这一过程就可以利用GPU并行计算来加速。因此,使用GPU加速,训练时间就会缩短很多。

3.3 模型大小

除了训练时间之外,还有一个重要的因素是模型的大小。在模型的每一步迭代中,CatBoost都会在计算图中添加一颗树,因此树的个数、深度和叶子结点的数量会逐步增加。当树的数量和深度达到一定程度时,模型的大小可能会变得非常大,而且这些参数都是手动设定的,无法确定一个合适的值。

而采用GPU进行训练后,由于可以使用并行计算,因此可以充分利用GPU的并行计算资源,不会受限于CPU的资源限制,可以大大加快训练速度。所以,在相同数据量的情况下,CatBoost GPU加速的训练速度要远远快于CART CPU加速的训练速度。

4. CatBoost如何利用GPU进行训练

4.1 GPU实现

目前,CatBoost已经自带了GPU加速的版本。既然有了GPU,为什么还要自己手动实现呢?这里有两个原因:

  1. 尽管目前有许多开源的库都可以支持GPU,但是它们往往存在与用户的交互过程,不太方便使用。
  2. 在实际生产环境中,我们可能没有足够的GPU资源来训练所有的模型,所以需要按需分配资源。

因此,CatBoost采用了分布式计算的思想,将模型的训练过程分解成多个小任务,由不同的GPU完成。这样,我们就可以实现按需分配资源的目的。

下面我们就来看一下CatBoost是如何利用GPU进行训练的。

首先,CatBoost按照树的个数和树的深度的不同,划分成不同的任务,每个任务对应于一个GPU,需要完成的工作就是拟合残差并添加一颗树。由于数据并不是均匀分布的,所以不同的任务需要分配到不同的GPU上,这就是所谓的“数据并行”。

其次,CatBoost为了提升效率,在每个任务中使用了延迟计算机制。比如,当某个任务发现当前的切分特征的分割点过于偏向某一边时,它并不立刻执行切分操作,而是等待其它任务结束之后再执行。这种方式可以避免重复计算相同的切分特征,节省了计算资源。

第三,CatBoost采用了基于梯度的更新方式,将损失函数在树节点处的导数作为权重,来拟合残差。梯度下降法是一种常用的优化算法,可以求解无约束优化问题,并且能保证全局最优解。在CatBoost中,每一颗树的损失函数由叶节点的输出值和输入值计算得到,利用链式法则求解残差,并将残差的导数作为权重,更新叶节点的值。这样做可以保证树的高度和宽度不减少,使得模型整体的泛化能力不受到影响。

最后,CatBoost还提供了分布式计算的接口,用户可以通过设置参数来指定使用多少个GPU,并使用分布式计算库(如Horovod、Spark等)启动多进程训练。这样,可以实现多机多卡的训练,有效利用GPU资源,提高训练效率。

4.2 案例

下面让我们举一个案例,展示一下GPU加速训练CatBoost的具体步骤。假设我们要训练一个二分类模型,有1亿条记录,有3千个特征,共有40个类别标签,模型大小不大。

4.2.1 安装依赖包

pip install catboost gpu

4.2.2 分布式训练

由于数据量比较大,为了加速训练,我们使用分布式训练。在分布式训练中,我们将模型训练任务分成多个GPU,每台机器上运行一个进程。因此,我们需要安装Horovod来实现分布式训练。

pip install horovod

4.2.3 配置GPU数量

我们配置4个GPU训练:

import os
os.environ["CUDA_VISIBLE_DEVICES"] = "0,1,2,3"

4.2.4 加载数据

由于数据量比较大,所以加载数据的时候,可以采取分批读取的方式,防止占满内存。

import numpy as np
from sklearn import datasets
from sklearn.model_selection import train_test_split

def load_data():
    data, target = datasets.make_classification(
        n_samples=int(1e8), # 1 million records
        n_features=3000, # 3k features
        n_classes=2, # binary classification problem
        random_state=0
    )

    X_train, X_val, y_train, y_val = train_test_split(data, target, test_size=0.2, random_state=42)

    return (X_train, y_train), (X_val, y_val)

4.2.5 创建模型

创建CatBoostClassifier模型:

import catboost

def create_model():
    model = catboost.CatBoostClassifier(
        loss_function='Logloss', 
        eval_metric='Accuracy',
        task_type="GPU",
        devices=['gpu:0','gpu:1','gpu:2','gpu:3'],
        boosting_type='Plain'
    )

    return model

4.2.6 设置参数

params = {
    'learning_rate': 0.1, 
    'depth': 6, 
    'l2_leaf_reg': 3,
    'iterations': 100,
    'early_stopping_rounds': 10,
   'verbose': False
}

4.2.7 执行训练

import time
from sklearn.metrics import accuracy_score
from tensorflow.keras.utils import to_categorical
import horovod.tensorflow.keras as hvd

hvd.init()

if __name__ == '__main__':
    (X_train, y_train), (X_val, y_val) = load_data()
    X_train = np.array(X_train, dtype=np.float32)
    X_val = np.array(X_val, dtype=np.float32)
    y_train = np.array(to_categorical(y_train))
    y_val = np.array(to_categorical(y_val))

    model = create_model()
    optimizer = keras.optimizers.Adam(lr=params['learning_rate'])
    optimizer = hvd.DistributedOptimizer(optimizer)

    @tf.function
    def train_step(inputs, targets):
        with tf.GradientTape() as tape:
            predictions = model(inputs)
            loss = keras.losses.binary_crossentropy(targets, predictions)

        gradients = tape.gradient(loss, model.trainable_variables)
        optimizer.apply_gradients(zip(gradients, model.trainable_variables))

        acc = accuracy_score(np.argmax(targets, axis=1), np.argmax(predictions, axis=1))

        return {'accuracy': acc}

    for epoch in range(params['epochs']):
        start_time = time.time()
        history = {}

        if hvd.rank() == 0:
            print(f"\nEpoch {epoch+1}/{params['epochs']}")

        for step in tqdm(range(num_batches)):
            batch_start = step * params['batch_size']
            batch_end = min((step + 1) * params['batch_size'], num_records)

            x_batch = X_train[batch_start:batch_end]
            y_batch = y_train[batch_start:batch_end]

            metrics = train_step(x_batch, y_batch)

            for metric, value in metrics.items():
                if metric not in history:
                    history[metric] = []

                history[metric].append(value)

        end_time = time.time()
        epoch_time = int(end_time - start_time)
        total_steps = len(history['accuracy'])
        avg_acc = sum(history['accuracy']) / float(total_steps)

        if hvd.rank() == 0 and epoch % 10 == 0:
            print("Epoch average accuracy:", round(avg_acc, 4))
            print("Time taken:", str(datetime.timedelta(seconds=epoch_time)))

    val_pred = model.predict(X_val).flatten()
    val_true = y_val[:,1]
    val_acc = accuracy_score(val_true, val_pred > 0.5)

    if hvd.rank() == 0:
        print("\nValidation Accuracy:", round(val_acc, 4))

5. 使用GPU进行加速时的注意事项及优化策略

5.1 模型调参

为了利用GPU加速,我们应该对模型的参数进行调优,以达到最优的效果。我们可以通过设置不同的学习率、树的深度、叶子节点上正则化系数等参数,来尝试不同的组合。

5.2 数据规模

数据规模对GPU加速的效果还是很大的。在实际使用中,我们可以按照数据量和模型规模的大小来决定采用GPU还是CPU,比如,数据量比较小的情况我们可以采用CPU进行训练,数据量比较大的情况我们可以采用GPU进行训练。

5.3 网络配置

如果我们的数据量比较小,网络配置上,推荐采用单机单卡或者单机多卡的方式,因为单机单卡的配置比较容易管理,不会出现瓶颈。而对于数据量比较大的情况,如果我们使用单机单卡的话,可能会导致网络带宽成为瓶颈。因此,我们可以采用多机多卡的方式,使用分布式计算集群来进行训练。

5.4 网络带宽

网络带宽也是影响训练效率的关键因素。当我们的数据量比较大时,我们的GPU可能会被其他应用占用掉,导致训练速度变慢。所以,我们需要根据实际情况,调整网络带宽或者关闭其他应用。

6. 在线和离线训练对GPU加速的影响

6.1 在线训练

在线训练是指模型正在训练过程中,还有数据需要处理。当模型训练到一半遇到错误时,重新加载上一次的checkpoint,继续训练即可。

采用GPU进行训练,在线训练的过程并不会影响到训练速度。也就是说,不需要额外的数据处理,模型仍旧可以持续的在线训练。

6.2 离线训练

离线训练是指模型训练完毕后,存储整个模型,下次直接加载模型,不需要再次训练。CatBoost模型默认支持将模型保存为文本文件,可以用于离线部署。

由于CatBoost的模型可以保存为文本文件,因此可以在任何地方加载模型,而不需要考虑平台的依赖关系。同样,训练好的模型还可以通过HTTP接口发布出来,供其他平台调用。因此,对于某些特定的业务需求,采用离线训练模式,配合HTTP接口发布模型,可以实现跨平台的部署。

7. 为何用GPU可以带来的训练加速效果

7.1 更快的训练速度

我们都知道,GPU的计算能力远超CPU,所以用GPU可以加快模型训练的速度。

另外,CatBoost的算法设计采用了新的方法,能够更好地利用并行计算的资源。利用GPU并行计算,可以减少训练时间,从而提升训练效率。

7.2 大数据处理能力

目前,GPU上的大数据处理能力已经取得了很大的进步,比如,NVidia Tesla P100和V100都支持超过50GB/s的高带宽,能够处理非常庞大的模型。所以,采用GPU进行模型训练时,我们就可以处理非常大的数据。

7.3 节约内存

当模型的大小和数据量都比较大时,我们可以使用GPU来训练,可以大大节约内存。由于GPU的内存通常比CPU的内存大很多,因此可以利用更多的内存来进行训练。

8. GPU的算力是怎样体现出来的?

8.1 流水线技术

GPU内部有多个流水线,每条流水线可以处理一个或多个数据。不同流水线之间有数据依赖关系,所以能够很好地并行处理多个数据。

8.2 线程级并行技术

在GPU内,每个SM(Streaming Multiprocessor)核都包含多个线程。不同线程之间共享数据,所以在GPU上进行并行计算时,可以充分利用多线程的并行计算能力。

8.3 矢量化技术

在GPU上进行矩阵乘法运算时,可以将多个运算合并为矢量操作,从而提升运算效率。

9. 最后总结一下,我们能从本文所述内容中获得哪些启发或收获?

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